É possível efetuar a Transferência de vários Funcionário entre empresas no MGEPessoal?

Sim. Atualmente  é possível efetuar a transferência em 'massa' de Funcionários, entre empresas, marcando a opção 'Transferência coletiva'

A Rotina que efetua a transferência é: MGEPessoal>>Rotinas>>Transferência de Funcionários entre empresas.

Opção disponível a partir das versões:
4.29.0.33
4.30.0.15
4.31.0.0

Observação:
Comportamento do sistema para eSocial:

O eSocial através da Nota Orientativa 2018.12 estabelece que a empresa de origem deverá enviar o evento 2299- Desligamento com o motivo de desligamento nº 11 "Transferência de empregado para empresa do mesmo grupo empresarial que tenha assumido os encargos trabalhistas, sem que tenha havido rescisão do contrato de trabalho".

Posteriormente a empresa de destino deverá enviar o evento 2200- Cadastramento Inicial do Vínculo e Admissão/Ingresso de Trabalhador com o campo {tpAdmissao} igual a 2 'Transferência de empresa do mesmo grupo econômico', mantendo a data da admissão inicial e informando a data da transferência.